Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1E9PL57 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms