Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
E9PBE3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
E9PBE3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
E9PBE3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E9PBE3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
E9PBE3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E9PBE3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E9PBE3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E9PBE3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E9PBE3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E9PBE3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E9PBE3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E9PBE3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E9PBE3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E9PBE3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
E9PBE3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
E9PBE3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E9PBE3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E9PBE3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E9PBE3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E9PBE3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E9PBE3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E9PBE3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E9PBE3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E9PBE3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E9PBE3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E9PBE3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E9PBE3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E9PBE3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E9PBE3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E9PBE3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E9PBE3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E9PBE3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E9PBE3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E9PBE3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E9PBE3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E9PBE3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E9PBE3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E9PBE3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E9PBE3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E9PBE3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E9PBE3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E9PBE3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E9PBE3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E9PBE3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E9PBE3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E9PBE3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E9PBE3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
E9PBE3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E9PBE3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E9PBE3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E9PBE3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E9PBE3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E9PBE3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E9PBE3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E9PBE3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E9PBE3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E9PBE3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E9PBE3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
E9PBE3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms