Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCRIP1C9JLW8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms