Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms