Protein–RNA interactions for Protein: B4DJY2

TMEM233, Transmembrane protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM233B4DJY2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM233B4DJY2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms