Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L4A6NEF3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L4A6NEF3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L4A6NEF3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L4A6NEF3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L4A6NEF3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L4A6NEF3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L4A6NEF3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L4A6NEF3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L4A6NEF3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L4A6NEF3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L4A6NEF3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L4A6NEF3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L4A6NEF3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L4A6NEF3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L4A6NEF3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L4A6NEF3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L4A6NEF3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L4A6NEF3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L4A6NEF3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L4A6NEF3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L4A6NEF3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L4A6NEF3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L4A6NEF3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L4A6NEF3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L4A6NEF3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms