Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
USP17L4A6NCW7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L4A6NCW7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L4A6NCW7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L4A6NCW7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP17L4A6NCW7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms