Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms