Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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