Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6S5

IGKV1-27, Immunoglobulin kappa variable 1-27, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-27A0A075B6S5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGKV1-27A0A075B6S5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
IGKV1-27A0A075B6S5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IGKV1-27A0A075B6S5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
IGKV1-27A0A075B6S5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGKV1-27A0A075B6S5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IGKV1-27A0A075B6S5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IGKV1-27A0A075B6S5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IGKV1-27A0A075B6S5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms