Protein–RNA interactions for Protein: U3KPZ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,027 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KPZ7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KPZ7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KPZ7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KPZ7 LINC02349-201ENST00000561386 963 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KPZ7 AP001020.1-201ENST00000579595 464 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KPZ7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KPZ7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KPZ7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KPZ7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KPZ7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KPZ7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KPZ7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KPZ7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KPZ7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KPZ7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KPZ7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KPZ7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KPZ7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KPZ7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KPZ7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KPZ7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KPZ7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KPZ7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KPZ7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KPZ7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KPZ7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KPZ7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KPZ7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KPZ7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KPZ7 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KPZ7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KPZ7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KPZ7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KPZ7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KPZ7 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KPZ7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KPZ7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KPZ7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KPZ7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KPZ7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KPZ7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KPZ7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KPZ7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KPZ7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KPZ7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KPZ7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KPZ7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KPZ7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KPZ7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KPZ7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KPZ7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KPZ7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KPZ7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KPZ7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KPZ7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KPZ7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KPZ7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KPZ7 FABP5-201ENST00000297258 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KPZ7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KPZ7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KPZ7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KPZ7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KPZ7 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KPZ7 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KPZ7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KPZ7 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KPZ7 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms