Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC61Q9Y6R9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC61Q9Y6R9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms