Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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SNX13Q9Y5W8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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SNX13Q9Y5W8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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SNX13Q9Y5W8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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SNX13Q9Y5W8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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SNX13Q9Y5W8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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SNX13Q9Y5W8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX13Q9Y5W8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
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