Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHLDA3Q9Y5J5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms