Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG6Q9Y2V7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COG6Q9Y2V7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms