Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM2AQ9Y2K7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms