Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD4AQ9UPU9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAMD4AQ9UPU9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms