Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN3Q9UPQ7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms