Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW6

NAP1L2, Nucleosome assembly protein 1-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L2Q9ULW6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NAP1L2Q9ULW6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NAP1L2Q9ULW6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NAP1L2Q9ULW6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NAP1L2Q9ULW6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NAP1L2Q9ULW6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NAP1L2Q9ULW6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NAP1L2Q9ULW6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NAP1L2Q9ULW6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NAP1L2Q9ULW6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NAP1L2Q9ULW6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NAP1L2Q9ULW6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NAP1L2Q9ULW6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NAP1L2Q9ULW6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NAP1L2Q9ULW6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NAP1L2Q9ULW6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NAP1L2Q9ULW6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NAP1L2Q9ULW6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NAP1L2Q9ULW6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NAP1L2Q9ULW6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NAP1L2Q9ULW6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NAP1L2Q9ULW6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms