Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PNMA8BQ9ULN7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms