Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPNE7Q9UBL6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms