Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHPF2Q9P2E5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms