Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP36Q9P275 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP36Q9P275 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP36Q9P275 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP36Q9P275 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP36Q9P275 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
USP36Q9P275 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms