Protein–RNA interactions for Protein: Q9P000

COMMD9, COMM domain-containing protein 9, humanhuman

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD9Q9P000 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COMMD9Q9P000 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COMMD9Q9P000 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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