Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYH9

UTP6, U3 small nucleolar RNA-associated protein 6 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP6Q9NYH9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms