Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRMT1Q9NXH9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRMT1Q9NXH9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRMT1Q9NXH9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRMT1Q9NXH9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRMT1Q9NXH9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRMT1Q9NXH9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRMT1Q9NXH9 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRMT1Q9NXH9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRMT1Q9NXH9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRMT1Q9NXH9 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRMT1Q9NXH9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRMT1Q9NXH9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRMT1Q9NXH9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRMT1Q9NXH9 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRMT1Q9NXH9 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRMT1Q9NXH9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRMT1Q9NXH9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRMT1Q9NXH9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRMT1Q9NXH9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRMT1Q9NXH9 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRMT1Q9NXH9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRMT1Q9NXH9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRMT1Q9NXH9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMT1Q9NXH9 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms