Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHCHD3Q9NX63 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHCHD3Q9NX63 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms