Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN6Q9NWW5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN6Q9NWW5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms