Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms