Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT84Q9NSB2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms