Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPHK2Q9NRA0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPHK2Q9NRA0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms