Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms