Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMBRA1Q9C0C7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms