Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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