Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms