Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BBS2Q9BXC9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BBS2Q9BXC9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms