Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
FYCO1Q9BQS8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FYCO1Q9BQS8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms