Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms