Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MYD88Q99836 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYD88Q99836 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms