Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms