Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBBP8Q99708 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms