Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT140Q96RY7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT140Q96RY7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT140Q96RY7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT140Q96RY7 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT140Q96RY7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT140Q96RY7 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT140Q96RY7 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT140Q96RY7 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT140Q96RY7 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT140Q96RY7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT140Q96RY7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT140Q96RY7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT140Q96RY7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IFT140Q96RY7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFT140Q96RY7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
IFT140Q96RY7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFT140Q96RY7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
IFT140Q96RY7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
IFT140Q96RY7 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms