Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms