Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEURL4Q96JN8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NEURL4Q96JN8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms