Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 LINC00648-204ENST00000557749 443 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 AC015910.1-202ENST00000580264 633 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 LINC01892-202ENST00000583985 540 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 OPRM1-210ENST00000452687 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 FCHO2-201ENST00000287761 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC096732.1-201ENST00000439565 477 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MS4A3Q96HJ5 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms