Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV0

LRRC46, Leucine-rich repeat-containing protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC46Q96FV0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC46Q96FV0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms