Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RSPRY1Q96DX4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSPRY1Q96DX4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSPRY1Q96DX4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RSPRY1Q96DX4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSPRY1Q96DX4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSPRY1Q96DX4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSPRY1Q96DX4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RSPRY1Q96DX4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RSPRY1Q96DX4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RSPRY1Q96DX4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RSPRY1Q96DX4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RSPRY1Q96DX4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RSPRY1Q96DX4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms