Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ATG4CQ96DT6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4CQ96DT6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms