Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms