Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSAQ969W0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms